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Unité d'anthropologie

Unité d'anthropologie | Université de Genève

Thomas Goeury

PhD

Assistant au Laboratoire d'Anthropologie et Génétique de Peuplement.
En doctorat sous la supervision du Pr. Sanchez-Mazas: Analyse in silico de la répartition de gènes HLA dans des populations humaines.

Présentation

Mes recherches portent sur les gènes du complexe majeur d'histocompatibilité chez l'humain (complexe HLA, pour Human Leukocyte Antigens). Je suis intéréssé par l'usage de ces gènes et des techniques de séquençage haut-débit (NGS) afin de retracer l'histoire évolutive et comprendre la diversité génétique des populations humaines: effet de l'environnement (la pression des pathogènes), de la géographie, de la linguistique.

Je suis tout particulièrement intéréssé par le traitement ces données à l'aide de l'outil informatique (Linux), des bases de données (SQL) aux languages de programation (Python, R) et à l'utilisation de techniques avancées de statistiques (apprentissage machine notamment) pour répondre à ces questions.

Je suis membre de la Fédération Européenne d'Immunogénétique (EFI )

Je participe aussi, dans le cadre de mon statut d'assistant et avec l'aide d'autres collaborateurs, à des enseignements dispensés par l'Université de Genève dans mon domaine:

  • Cours d'Informatique pour Biologistes du Pr. Falcone;
  • Séminaire de méthodologie de la recherche, Laboratoire AGP
  • Stage de Génétique moléculaire des populations et Cours de Biologie humaine du Pr. Sanchez-Mazas;
  • Stage "Computer Skills for Biological Research" du Dr. Currat;
  • Cours de "Statistics and Probability" du Dr. Nunes;

Je vous invite à me contacter directement ou consulter mon profil LinkedIn LinkedIn afin de trouver plus d'informations.

Mes travaux ont étés présentés :

  • 2016: Congrès annuel de l'EFI à Kos, Grèce: "From SSO to NGS in HLA population studies: the case of Mandenka (Senegal)"
  • 2017: Congrès annuel de l'EFI à Mannheim, Allemagne: "The use of entropy to describe HLA molecular Information"
  • 2017: Conférence annuelle "Biology 17" à Bern, Suisse: "From SSO to HTS in HLA population studies: Diving into the fine nucleotide diversity of HLA genes". La présentation

Mes travaux de recherches sont aussi publiés en open-acces:

  • Goeury T, Creary LE, Brunet L, et al. Deciphering the fine nucleotide diversity of full HLA class I and class II genes in a well-documented population from sub-Saharan Africa. HLA. 2018;91:36–51. https://doi.org/10.1111/tan.13180
  • Mandenka from Senegal: Next Generation Sequencing typings reveal very high frequencies of particular HLA class II alleles and haplotypes. HLA. In press.

Thomas Goeury
Thomas Goeury
Université de Genève
Dépt. de Génétique & Evolution
Unité d'anthropologie
Quai Ernest-Ansermet 30
1205 Genève
Suisse
Tél. +41 22 379 69 67
Fax. +41 22 379 31 94